无需逐张图像搜索,即可直观查看整个样本 - 快速查找感兴趣的区域

在从图像到图像的搜索中切换到快速查看整个样本概览,并即刻识别重要的样本细节。利用这些知识,使用载玻片、培养皿和多孔板的模板自动设置高分辨率图像采集。LAS X Navigator软件像是样本细胞的GPS,总能为用户指明通向高质量数据的清晰路径,这是生命科学平台STELLARIS和THUNDER成像仪上的一款导航工具。LAS X Navigator支持将宽场、立体或共聚焦实验与舞台应用相结合。
用户可以迅速获得标本的整体概览,找到感兴趣区域(ROI),然后使用LAS X Navigator软件轻松获取高分辨率图像。原因包括:
1
快速定位样品:

在培养皿中找到标记清晰的细胞或在大块脑组织切片中找到特定的ROI既困难又耗时。因为许多生物样本的大小超过了显微镜的最大视场,这让用户很难确定自己在样本中的位置。
通过LAS X Navigator的螺旋扫描功能,可以快速创建样本概览,选择用于进一步研究的ROI。用户只需点击一下,就能获取以当前视场为中心的马赛克扫描。
视频 1:快速螺旋扫描大样本,以便在选择 ROI 之前对样本有一个总体了解。样本由荷兰乌特勒支胡布勒支研究所的 Carlos Sacristan Lopez 博士提供。
2
在不同尺寸比例间无缝工作:

用户在获取整体样本的同时,也希望看到样本细节。这意味着必须在不同尺寸比例间无缝切换。
用户可以通过LAS X Navigator软件在不同的目标之间迅速切换,并以适当的细节级别扫描样本。
更换物镜时,所有相关的拼图的大小和位置参数都会自动重新计算。此外,查看器功能可以显示多个记录的叠加,包括使用不同物镜获得的记录。这样,用户可以首先快速获取概览,然后使用高分辨率的z堆栈从多个任意形状的ROI查看细节,从而无缝地在不同尺度上探索样本。
3
在大样本和时间延迟记录期间保持对焦:

在进行此类实验时,生物样本和探针载体通常不是平整的,这些几何缺陷和样本在时间延迟记录期间的漂移都可能导致失焦问题。
LAS X Navigator软件提供了多种解决这些问题的方法。它可以通过手动或自动定义任意数量的焦点,以创建所谓的“焦点图",以便对适当的z位置进行插值。此外,由于“自适应焦点控制"(AFC)已集成到软件中,因此提供了一种非侵入性、快速的方法,可以在较长时间内保持样品对焦。

图 1:LAS X Navigator可以定义任意数量的焦点来构建焦点图。
4
化验编辑和统计抽样:

当用户希望同时探查多种操作并希望获得具有统计意义的结果时,自然会选择使用多孔载体以提高吞吐量。手动设置这类实验既繁琐也限制了生产率,因为每个孔都必须手动获取多个成像位置。
使用LAS X Navigator软件的化验编辑器(需单独购买许可证),用户可以使用包括载玻片、培养皿和多孔板在内的多种常见探针载体。用户只需选择正确的载体,并选择他们希望如何对每个孔进行统计抽样。这种方法可以快速设置,从而专注于获取有意义的结果。

图 2:化验编辑器中标准载体的两个示例。
预定义的 Navigator 可以进一步加快速度。在下面的示例中,使用配备量子平台的 DMi8 宽场系统加载并执行了一个 8 室载玻片协议,每个孔中有 3 个位置。
5
综合图像拼接和分析

获取高质量数据固然重要,但此时实验尚未完成。用户仍然需要拼接单张扫描图像并进行图像分析。为此,LAS X Navigator 软件为此类工作流程提供了便利: 图像采集完成后,可选择使用选定的拼接算法自动合并单个拼图。此外,三维分析模块(许可证可单独获取)的处理功能已集成到软件中,以支持整个工作流程。例如,处理流水线可用于描述刚刚记录的细胞核,即分割细胞核、计数细胞核、测量细胞核大小等。

图 3:LAS X 导航仪拼接图像上的 3D 分析模块。
6
图像融合,整合外部图像信息

如果样品的预扫描已经用另一个系统(例如徕卡宽场显微镜)完成,而现在需要用 STELLARIS 共聚焦显微镜进行高分辨率扫描,该怎么办?用户自然希望将这些成像数据结合起来。不同来源的图像可以通过 LAS X Navigator 软件进行导入和对齐。
用户只需选择要导入软件的图像,然后使用工具箱快速对齐图像。这样,即使是智能手机摄像头的快照也可以用作鸟瞰图,用于定义 ROI 并自动扫描。

图 4:LAS X 导航仪可从其他来源导入图像。在所示示例中,共焦图像与相机快照对齐。
7
将基于荧光寿命的成像技术与 STELLARIS(TauSense 和 FALCON)相结合

有时,用户需要分离光谱重叠的荧光团,减少对信号的无用贡献或研究微环境变化。虽然基于强度的成像信息仍然是荧光显微镜使用最多的维度,但许多人已经学会欣赏基于荧光寿命的成像。
LAS X 导航仪允许用户通过舞台应用程序获取荧光寿命数据。
TauSense 工具可用于 LAS X 导航仪,使用 TauContrast 记录平均到达时间的差异,或使用 TauSeparation 区分某些光谱重叠的荧光团。此外,FALCON 与 LAS X Navigator 兼容。

图 5:蛔虫横切面上不同结构的识别。将基于荧光寿命的信息和荧光强度与阶段应用相结合,可提供额外的对比度来区分不同的结构。LAS X 导航仪可在整个标本上无缝执行这项任务。
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